基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的蘆筍EST-SSR標(biāo)記的開發(fā)及通用性分析
中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)
頁(yè)數(shù): 16 2023-11-16
摘要: 【目的】明確蘆筍轉(zhuǎn)錄組中SSR位點(diǎn)的分布規(guī)律,開發(fā)高信息量的EST-SSR標(biāo)記并分析通用性,為天門冬屬植物系統(tǒng)進(jìn)化分析、功能基因挖掘及分子標(biāo)記輔助育種提供工具。【方法】以筆者課題組前期獲得的15個(gè)蘆筍根系RNA-seq數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),采用MISA軟件檢索SSR位點(diǎn)、Primer 3.0軟件批量設(shè)計(jì)引物及TB-tools軟件批量e-PCR與Primer-blast程序逐一e-PCR相...