基于轉(zhuǎn)錄組序列的非洲菊密碼子偏好性分析
西南林業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué))
頁數(shù)： 10 2023-04-21
摘要： 利用CodonW 1.4.2和在線軟件CUSP分析非洲菊轉(zhuǎn)錄組13 769條編碼序列的密碼子堿基組成、同義密碼子相對使用度和密碼子偏好性，并通過中性繪圖分析、ENC-plot和PR2-plot分析影響密碼子偏好性的因素。結(jié)果表明：非洲菊編碼基因序列的密碼子偏好性整體偏弱，影響密碼子偏好性的主要因素為突變，同時確定UUG、UUU、UAU、AUU、UGU、GUU、AGA、GGU、U...
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