通過(guò)圖注意力網(wǎng)絡(luò)識(shí)別空間轉(zhuǎn)錄組中的空間域

摘要： 由于數(shù)據(jù)的高維和復(fù)雜性，空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分析一直是一個(gè)具有挑戰(zhàn)性的問(wèn)題，而聚類分析則是空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的核心問(wèn)題。本文提出了一種基于圖注意力網(wǎng)絡(luò)的深度學(xué)習(xí)方法，用于空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的聚類分析。首先，對(duì)空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行增強(qiáng)，然后使用圖注意力網(wǎng)絡(luò)對(duì)節(jié)點(diǎn)進(jìn)行特征提取，最后使用萊頓（Leiden）算法進(jìn)行聚類分析。通過(guò)聚類的評(píng)價(jià)指標(biāo)發(fā)現(xiàn)，與傳統(tǒng)的非空間及空間聚類方法相比，本文提出的方...