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基于高通量測(cè)序的不同生態(tài)環(huán)境東方澤瀉塊莖轉(zhuǎn)錄組分析

中國(guó)現(xiàn)代中藥 頁(yè)數(shù): 8 2022-10-05
摘要: 目的:探索不同生態(tài)環(huán)境對(duì)東方澤瀉生理活動(dòng)及其藥效成分原萜烷型三萜生物合成調(diào)控的分子基礎(chǔ)。方法:通過(guò)Illumina HiSeq測(cè)序平臺(tái)獲取種植于福建和四川的東方澤瀉塊莖轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)并進(jìn)行功能注釋,基于|log2FC|>0.58 (FC為差異倍數(shù))、P<0.05的篩選條件獲得差異表達(dá)基因。結(jié)果:轉(zhuǎn)錄組測(cè)序共獲得50 652條unigenes,有22 689條unigenes注釋到...

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