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基于全長轉(zhuǎn)錄組測序的多花黃精WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族分析

中國中藥雜志 頁數(shù)： 12 2022-11-04
摘要： WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族在植物生長發(fā)育、次生代謝產(chǎn)物合成、生物和非生物脅迫響應(yīng)等過程發(fā)揮著重要的作用。該研究采用PacBio SMRT高通量測序技術(shù)對多花黃精進(jìn)行全長轉(zhuǎn)錄組測序，利用生物信息學(xué)手段從多花黃精全長轉(zhuǎn)錄組中鑒定WRKY家族成員，分析其理化性質(zhì)、亞細(xì)胞定位、系統(tǒng)進(jìn)化信息及保守基序。結(jié)果顯示，多花黃精全長轉(zhuǎn)錄組測序共獲得30.69 Gb數(shù)據(jù)，去冗余后得到89 564條轉(zhuǎn)錄本...

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